H δικαστική συνεργασία σε ποινικά θέματα επιτυγχάνεται με την εφαρμογή των διμερών και πολυμερών διεθνών συμβάσεων στις οποίες η Δημοκρατία είναι συμβαλλόμενο μέρος, καθώς και με την εφαρμογή του ευρωπαϊκού κεκτημένου. Κυριότεροι τομείς συνεργασίας σε θέματα ποινικού δικαίου είναι οι ακόλουθοι:

α) Aμοιβαία Δικαστική Συνδρομή

β) Έκδοση Φυγοδίκων

γ) Mεταφορά Καταδίκων

Η Ευρωπαϊκή Ένωση με στόχο τη βελτίωση της δικαστικής συνεργασίας μεταξύ των κρατών μελών της έχει δημιουργήσει και λειτουργήσει το Ευρωπαϊκό Δικαστικό Δίκτυο για ποινικές υποθέσεις.